После трагической утраты Джин Грей Логан решает оставить прошлое позади. Он уходит в изоляцию, скрывается в канадских лесах, где горечь утраты и бессмертия поглощает его душу. Его единственным утешением становятся алкоголь и туманное забвение. Но однажды его одиночество нарушает странная встреча с Юкио — молодой японкой, которая приносит просьбу от Ичиро Яшиды, человека, которого Логан знал ещё в 1945 году, в лагере военнопленных. С того времени прошло много лет, и теперь Ичиро, став старым и больным, нуждается в помощи.

Ичиро обращается к Логану с необычной просьбой: обменять его бессмертие на шанс прожить нормальную, человеческую жизнь. За этой просьбой скрываются не только личные мотивы, но и опасные интриги. Логан отправляется в Токио, надеясь на ответы и покой, но сталкивается с угрозами, зловещими силами и предательствами, которые заставляют его вновь бороться за жизнь — свою и тех, кого он когда-то защищал.

Коул Янг — обычный боец смешанных единоборств, который зарабатывает на жизнь драками, не подозревая, что его судьба гораздо сложнее, чем он думал. Его мир переворачивается, когда император Внешнего мира, Шан Цзун, посылает Саб-Зиро, мастера криомансера, на охоту за ним. Коул, не понимая, что происходит, начинает переживать за безопасность своей семьи. На помощь ему приходит майор спецназа Джакс, который, как и Коул, носит загадочную отметку в виде дракона.

По совету Джакса Коул встречает Сони Блейд, а вместе с ней и наёмника Канои они оказываются в храме Лорда Рейдена, Старшего Бога, защитника Земного царства. Здесь, в этом укромном месте, ему предстоит узнать о своем истинном предназначении. В храме Коул знакомится с мастерами боевых искусств Лю Каном и Кун Лао, которые обучают его таинственному искусству арканы — мощной силе, скрытой в его душе. Вместе с новыми союзниками Коул готовится к решающей битве за спасение Земного царства.