Питер Паркер, казалось бы, наконец-то находит свой баланс между жизнью студента и Человеком-пауком. Учёба идет как по маслу, город его ценит, а отношения с Мэри Джейн стремительно развиваются. Он готов сделать ей предложение и строит планы на будущее. Но, как часто бывает, всё меняется в один миг. В его жизни снова появляется Гарри Озборн, одержимый жаждой мести за смерть отца, и превращается в Нового Гоблина. Но это ещё не всё. На улицах Нью-Йорка появляется новый враг — Песочный Человек, с необычайной силой и разрушительными намерениями.

Но Питеру предстоит не только бороться с внешними угрозами. Когда на него попадает инопланетный симбиот, его костюм становится чёрным, а сам Питер — более жестоким и мстительным. С темной стороной своей личности он сталкивается лицом к лицу, и она начинает разрушать всё, что ему дорого. Теперь Питеру предстоит не только сразиться с врагами, но и восстановить отношения с близкими, бороться с собственной тенью, чтобы вернуть себе светлую сторону и сохранить всё, что он так сильно любит.