Десять лет спустя после событий первого эпизода Галактическая Республика балансирует на краю разрушения. Сепаратисты, под предводительством графа Дуку, набирают силу, объединяя планеты и корпорации в мощное противостояние, которое угрожает даже самым стойким джедаям. В этот момент Верховный канцлер Палпатин, мастер манипуляций, не упускает шанс захватить еще больше власти. Он инициирует создание армии клонов, чтобы защитить Республику, но этот шаг, как вскоре окажется, приведет к последствиям, которые никто не мог предсказать.

Тем временем, юный джедай Энакин Скайуокер оказывается втянут в личную драму: он получает задание охранять сенатора Падме Амидалу, что, конечно, приводит к зарождению запретной любви. Параллельно мастер Оби-Ван Кеноби отправляется на расследование, которое раскрывает заговор, связанный с армией клонов. Все эти события запускают цепочку, которая приведет к Клоническим войнам — кровопролитному конфликту, который изменит судьбу Галактики. В этом эпизоде переплетаются интриги, предательства и масштабные сражения, создавая основу для одного из самых тёмных периодов в истории далекой-далекой галактики.